В чемпионате Еврейской автономной области по футболу 2006 года принимали участие шесть команд. Это ФК "Биробиджан", "Локомотив" (Облучье), "Бира" (Биробиджанский район), "Урожай" (Смидович), "Амур" (Ленинское) и "Смена" (Ленинское). Несмотря на сенсационное поражение от "Урожая", чемпионский титул завоевал ФК "Биробиджан", который вот уже несколько лет кряду представляет ЕАО в первенстве России среди любительских команд. Серебряные награды у "Амура". Эта команда показала яркую, результативную игру (на ее счету две победы со счетом 5:0), но неудача в игре с ФК "Биробиджан", а также ничья с "Бирой" не позволили ей замахнуться на большее. Кстати, в августе "Амур" вполне достойно проявил себя на Кубке Дальнего Востока, поэтому вполне вероятно, что в 2007 году он примет участие в зональном турнире первенства России среди любителей. На третьем месте в чемпионате расположился "Урожай", основу которого составляют игроки одноименного команды, принимающей участие в региональных турнирах по хоккею с мячом.
В финале Кубка Еврейской автономной области сошлись две лучшие команды чемпионата. Ни в основное, ни в дополнительное время зрители забитых мячей так и не увидели. В серии пенальти удача была на стороне ФК "Биробиджан", чьи игроки трижды поразили ворота соперника, а вот футболистам "Амура" так и не удалось пробить вратаря биробиджанцев Василия Кравцова. Таким образом, ФК "Биробиджан" сделал своеобразный дубль, не только став чемпионом, но и завоевав Кубок области.